כשרוב האנשים חושבים על דלקת, הם מקשרים אותה עם מצבים כגון דלקת פרקים ואלרגיות. אך קיים אף קשר חזק בין חוסר איזון בצמחיית הבטן לבין רמת הדלקת בגוף. קנדידה אלביקנס מחוברת לדלקת במספר אופנים.
ראשית, מטבוליטים רעילים שהקנדידה מפיצה, תוצרי לוואי כגון אצטאלדהיד וחומצת השתן, עלולים להוביל לדלקת במעיים ובמקומות אחרים בגוף. שנית, דלקת מעיים עשויה למעשה להחמיר מצבים כגון מעי דולף, ויתר שמרים או חיידקים במעיים.
